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一种提高无参转录组微卫星标记多态性的筛选方法
- 专利权人:
- 中国水产科学研究院黄海水产研究所
- 发明人:
- 马爱军,崔文晓,黄智慧,刘志峰,刘晓菲,杨凯,张薇,唐启政,庄娇,曲江波
- 申请号：
- CN201711077448.3
- 公开号：
- CN107604047A
- 申请日:
- 2017.11.06
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2018
- 代理人:
- 汤东凤
- 摘要：
- 本发明提供一种提高无参转录组微卫星标记多态性的筛选方法，属于分子生物学领域，所述方法的筛选原则和步骤依次为，初步选择重复次数为主流文献推荐的重复次数的微卫星；其次选择每个样品的FPKM平均值≥40的微卫星；然后选择FPKM值差的绝对值≥20的微卫星；然后选择微卫星所在基因片段≥400的微卫星；然后去除处在基因片段头或者尾的微卫星；最后利用BSA技术对微卫星进行筛选。本发明方法为第一个系统化的转录组微卫星筛选方法，首次全面确定了多个筛选条件，避免了单个条件降低筛选的效果和准确度；本发明首次根据二代测序的特点，明确了转录组中微卫星筛选的先后条件，避免重复性筛选以及条件错位引起的微卫星标记的遗漏。
- 来源网站：
- 中国工程科技知识中心
- 来源网址：
- http://www.ckcest.cn/home/
