A method of disinfecting chlorine dioxide according to an embodiment of the present invention includes the steps of filling chlorine dioxide gas in a first space portion having a first inlet and a second inlet and a second outlet, Filling the second space portion communicating with the first space portion with the chlorine dioxide gas by opening the second access device And chlorine dioxide concentration of the first space portion becomes higher than chlorine dioxide concentration of the second space portion as the first space portion and the second space portion are filled with the chlorine dioxide gas.본 발명의 실시예에 따른 이산화염소를 이용한 공간 소독방법은, 하나가 열리면 다른 하나가 닫히는 제1 출입장치 및 제2 출입장치가 구비된 제1 공간부를 이산화염소 가스를 채우는 단계 상기 제2 출입장치가 열림으로써 상기 제1 공간부와 연통되는 제2 공간부를 이산화염소 가스를 채우는 단계 및 상기 제1 공간부 및 상기 제2 공간부가 상기 이산화염소 가스로 채워짐에 따라 상기 제1 공간부의 이산화염소 농도가 상기 제2 공간부의 이산화염소 농도에 비하여 높게 되는 단계를 포함한다.