Provided are a system and a method for processing coffee beans. The system for processing coffee beans according to an embodiment of the present invention comprises a fist drying unit for controlling a first moisture content of coffee beans; a spraying unit for straying a husk extract to the coffee beans transferred from the first drying unit; a stirring unit for stirring the coffee beans including the sprayed husk extract; and a second drying unit included in the stirring unit and controlling a second moisture content of the stirred coffee beans.커피 생두 가공 시스템 및 방법이 제공된다. 본 발명의 일 실시예에 따른 커피 생두 가공 시스템은, 커피 생두의 제1 함수율을 조절하는 제1 건조부, 상기 제1 건조부에서 이송된 상기 커피 생두에 왕겨 추출수를 분사하는 분사부, 분사된 상기 왕겨 추출수를 포함하는 상기 커피 생두를 교반하는 교반부 및 상기 교반부에 포함되고, 상기 교반된 커피 생두의 제2 함수율을 조절하는 제2 건조부를 포함한다.