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一种基于猪ERV 转座子插入多态性研发新型分子标记的方法
- 专利权人:
- 扬州大学
- 发明人:
- 宋成义,王伟,陈才,杨昆仑,张丽,沈丹,王赛赛,王宵燕,高波
- 申请号：
- CN201710928987.7
- 公开号：
- CN107523634A
- 申请日:
- 2017.10.09
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2017
- 代理人:
- 卢亚丽
- 摘要：
- 本发明涉及分子生物学和生物信息学领域，具体涉及一种基于猪ERV转座子插入多态性研发新型分子标记的方法。该方法是利用ERV的LTR序列作为查询序列，在猪公开的基因组寻找插入位点；每个插入位点分别向上游和下游延伸300‑500个核苷酸序列，下载每条序列；将获得的序列去除冗余并进行多序列比对，每条插入位点序列保留300‑500个ERV插入位点侧翼区核苷酸序列和LTR序列；再根据获得的序列信息设计检测引物，作为待验证分子标记引物；利用所得的待验证分子标记引物PCR扩增不同品种，或同一品种不同个体基因组样品，选取能清晰扩出条带且有多态性的引物组合，获得分子标记。本发明可以为猪的品系鉴定，育种中的标记辅助选择提供有用的分子标记。
- 来源网站：
- 中国工程科技知识中心
- 来源网址：
- http://www.ckcest.cn/home/
