endoscope system that the image pickup device-specific correction information can be set reliably I provide. In the endoscope system 1 including an image pickup device 244 for output from a plurality of pixels electrical signal after photoelectric conversion as image information to the outside, the imaging apparatus 244 and the setting apparatus 3 that is bidirectionally communicably connected, the The matching, the image pickup apparatus 244, the recording unit 244c and a setting device 3, the correction information corresponding to the identification information received from the imaging device 244 of the management server 4 database 42 for recording the identification information for identifying the image capturing apparatus 244 It is acquired from and records in the recording unit 244c is sent to the imaging apparatus 244.撮像素子固有の補正情報を確実に設定することができる内視鏡システムを提供する。複数の画素から光電変換後の電気信号を画像情報として外部へ出力する撮像装置244と、撮像装置244と双方向に通信可能に接続された設定装置3と、を備えた内視鏡システム1であって、撮像装置244は、撮像装置244を識別する識別情報を記録する記録部244cを備え、設定装置3は、撮像装置244から受信した識別情報に対応する補正情報を管理サーバ4のデータベース42から取得して撮像装置244に送信して記録部244cに記録する。