本发明提供了一种黄鳝抗菌肽的制备方法,属于基因工程技术领域,所述方法包括以下步骤:1)将黄鳝抗菌肽基因与载体连接构建重组载体;2)将步骤1)中获得的重组载体转入到毕赤酵母中获得重组菌株;3)将重组菌株以0.5~1.5%接种体积接种到BMGY培养基中诱导培养46~50h获得培养液;4)收集培养液中的菌体细胞进行破碎,获得细胞破碎液,镍柱收集和纯化所述细胞破碎液获得黄鳝抗菌肽;所述黄鳝抗菌肽基因具有SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列;所述菌体细胞采用蜗牛酶孵育后与Triton X‑100、PMSF混合在超声作用下实现破碎。所述方法获得的黄鳝抗菌肽表达量高、活性好,对多种细菌均有抑制作用。