一种基于GEMMA的GWAS分析方法及装置
- 专利权人:
- 北京市农林科学院
- 发明人:
- 谢华,于洋,徐摇光
- 申请号：
- CN201611039234.2
- 公开号：
- CN106557657A
- 申请日:
- 2016.11.21
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2017
- 代理人:
- 关畅`孙楠
- 摘要：
- 本发明涉及一种基于GEMMA的GWAS分析方法及装置，其特征在于包括：将vcf文件一次性转换为GEMMA所需的bim、fam、bed文件；将所得bim,bed,fam文件通过GEMMA进行关联分析；对关联分析后的结果分别进行制作曼哈顿图、QQ图和SNP注释文件，完成GWAS分析。本发明将vcf文件和表型文件作为输入，一次性生成GWAS分析结果，大大提高了分析效率，使GWAS分析更加快捷，简单。使基于GEMMA的GWAS流程一体化，能灵活的分三个模块进行操作，也可一次性输入参数以执行整个流程，分析参数的调整十分灵活。
- 来源网站：
- 中国工程科技知识中心
