The present invention relates to a method for producing nanoparticles of an active substance using a lipid as a lubricant in a milling process, and more specifically, a mixture containing the active substance and a lipid as a lubricant and having a glass transition temperature of 80. The active substance can be conveniently used for medicines, cosmetics, functional foods, etc. by grinding the biocompatible polymer above ℃ with a roll mill and removing the lipid used as lubricant by using supercritical fluid. It relates to a method of manufacturing with nanoparticles.本発明は、脂質を製粉工程の潤滑剤として用いる活性物質のナノ粒子の製造方法に関し、さらに詳しくは、活性物質と潤滑剤としての脂質とを含む混合物及びガラス転移温度(glass transition temperature)が80℃以上の生体適合性高分子をロールミルで粉砕した後、超臨界流体を用いて潤滑剤として使用された脂質を除去することによって、活性物質を医薬品、化粧品、機能性食品などに便利に使用できるナノ粒子で製造する方法に関する。