The present invention provides a composition for treating or preventing transplant rejection or autoimmune disease, including cotton swab extract as an active ingredient. The composition of the present invention has the advantage of being effective in treating or preventing transplant rejection or autoimmune disease.본 발명은 유효성분으로 솜대 추출물을 포함하는 이식거부반응 또는 자가면역질환 치료 또는 예방용 조성물을 제공한다. 본 발명의 조성물은 이식거부반응 또는 자가면역질환 치료 또는 예방에 효과적이라는 장점을 갖는다.