A method, system and computer program for generating a registered image of a body part of a patient for use in an image guided surgical procedure is described. The method includes attaching a marker detectable by a tracking system to the body part before carrying out surgical steps. The tracking system has a reference frame and the position of the marker in the reference frame is detected. A first image of the body part is captured using an imaging system. An indication of the position of the first image relative to the reference frame of the tracking system is obtained. The first image is then mapped into registration with the position of the body part. The system includes an imaging system for capturing images of the body part. A tracking system detects a marker and determines the position of the marker in the reference frame of the tracking system. A marker is attachable to the body part and detectable by the tracking system. A computer control system is configured to obtain an indication of the position of the first image relative to the reference frame of the tracking system and to map the first image into registration with the position of the body part.La présente invention concerne un procédé, un système et un logiciel permettant de produire une image repérée dune partie de lanatomie dun patient devant subir une procédure chirurgicale guidée par imagerie. Le procédé nécessite de fixer sur la partie considérée, préalablement à la procédure chirurgicale, une balise détectable par un système de suivi. Ce système de suivi comportant un bâti de référence, on détecte la position de la balise dans le bâti de référence. Un système dimagerie permet de prendre une première image de la partie anatomique considérée, ce qui donne une indication de la position de la première image par rapport au bâti de référence du système de suivi. On établit alors une cartographie de la première image dans le système de repérage correspondant à la position de la partie anatomique. Le sy