本发明公开了一种细粒棘球蚴及加拿大棘球蚴二联亚单位疫苗及其制备方法;该二联亚单位疫苗包含免疫原dEG95/dEC95抗原蛋白和药学上可以接受的载体;其中,dEG95蛋白的氨基酸序列如SEQ ID No.1所示;dEC95蛋白的氨基酸序列如SEQ ID No.2所示。目前尚无同时抗细粒棘球蚴感染和加拿大棘球蚴感染的疫苗,本发明采用dEG95‑dEC95异源二聚体蛋白作为抗原,制备的抗细粒棘球蚴及加拿大棘球蚴二联亚单位疫苗生产成本低,生产工艺简单;可以同时预防细粒棘球蚴及加拿大棘球蚴的感染,具有安全、高效、成本低、抗原纯度高等诸多优点。