Disclosed are a BCI based SSVEP system and a method for operating the same. The BCI based SSVEP system comprises an EEG detection electrode unit which is attached to an occipital lobe of a user to measure a brainwave signal a target staring unit in which a plurality of eyeline staring targets consisting of texts and numbers are arranged and which includes a plurality of visual stimulators that are arranged between two of the eyeline staring targets and are lighted on/off by different frequencies and a processing unit which classifies and processes the brainwave signal outputted from the EEG detection electrode unit when the user stares each of the targets included in the target staring unit.COPYRIGHT KIPO 2014[Reference numerals] (121) Signal processing unit(122) Database(AA) Head of a humanBCI 기반의 SSVEP 시스템 및 이의 동작 방법을 개시한다. 상기 BCI 기반의 SSVEP 시스템은 사용자의 후두엽에 부착되어 뇌파 신호를 측정하도록 EEG 감지 전극부 복수 개의 문자 및 숫자인 시선 응시 타겟들이 배열되며, 상기 시선 응시 타겟들 중 2개 사이에 구비되어, 서로 다른 주파수로 점멸되는 복수 개의 시각 자극기가 구비된 타겟 응시부 및 사용자가 상기 타겟 응시부 내에 구비된 타겟들 각각을 응시함에 따라 상기 EEG 감지 전극부로부터 출력되는 뇌파 신호를 분류하여 처리하는 처리부를 포함한다.