There is provided a magnetic resonance imaging apparatus and a control method thereof that can obtain a sectional image of a target using a saturated pulse sequence that suppresses a magnetic resonance signal at a specific position, and realize a reduced FOV with elimination of the elimination. A magnetic resonance imaging apparatus according to one embodiment includes a part of a sperm element that forms a sperm element in a bore, a sloped coil part that applies a gradient to the formed sperm element, and an RF coil that applies an RF pulse to a target object located in the bore. A scanner including a portion; A sequence controller for controlling the scanner to apply a non-saturation pulse sequence to a first area of the object and applying a saturated pulse sequence to the first area of the object; Acquiring a first image by receiving a magnetic resonance signal from a first region of the object to which the non-saturation pulse sequence is applied, receiving a magnetic resonance signal from a first region of the object to which the saturation pulse sequence is applied to acquire a second image And a data processing unit for generating a difference image between the first image and the second image.특정 위치의 자기 공명 신호를 억제하는 포화 펄스 시퀀스를 이용하여 대상체의 단면 영상을 획득하고, 엘리어싱이 제거된 축소된FOV를 구현할 수 있는 자기 공명 영상 장치 및 그 제어 방법을 제공한다.일 실시예에 따른 자기 공명 영상 장치는, 보어에 정자장을 형성하는 정자장 코일부, 상기 형성된 정자장에 경사를 인가하는 경사 코일부 및 상기 보어에 위치하는 대상체에 RF 펄스를 인가하는 RF 코일부를 포함하는 스캐너; 상기 스캐너를 제어하여 상기 대상체의 제1영역에 비포화 펄스 시퀀스를 적용하고, 상기 대상체의 제1영역에 포화 펄스 시퀀스를 적용하는 시퀀스 제어부; 상기 비포화 펄스 시퀀스가 적용된 대상체의 제1영역으로부터 자기 공명 신호를 수신하여 제1영상을 획득하고, 상기 포화 펄스 시퀀스가 적용된 대상체의 제1영역으로부터 자기 공명 신호를 수신하여 제2영상을 획득하고, 상기 제1영상과 상기 제2영상의 차영상(difference image)을 생성하는 데이터 처리부;를 포함한다.