The present invention relates to an electronic payment system using fingerprint and/or finger vein recognition and a method thereof. The electronic payment system of the present invention is capable of processing payment by authenticating a payment method, which replaces a credit card, by using fingerprint and/or finger vein recognition. To achieve the purpose, a client registers fingerprint and/or finger vein information of the client in a fingerprint and/or finger vein payment service server by using a finger and/or finger vein payment application and a fingerprint and/or finger vein recognizer, and then, if a commercial transaction is generated, payment is processed by authenticating the finger and/or finger vein information of the client through a fingerprint and/or finger vein recognizer of an affiliate client. According to the present invention, gender identification information, in which a male is inputted as 1 and a female is inputted as 2, is a selective item when a fingerprint and/or a finger vein are registered through an application of the electronic payment system, and user authentication for electronic payment is processed through the fingerprint and/or finger vein information of the client, and thus, the present invention is capable of providing the convenience and security of the payment method replacing a credit card.본 발명은 지문 또는/및 지정맥 인식을 이용한 전자 결제 시스템 및 그 방법에 관한 것이다. 본 발명의 전자 결제 시스템은 지문 또는/및 지정맥 인식을 이용하여 신용 카드 대체용 결제수단을 인증 처리하여 결제가 이루어지도록 처리한다. 이를 위해 전자 결제 시스템은 고객 클라이언트에서 지문 또는/및 지정맥 결제 앱과 지문 또는/및 지정맥 인식기를 이용하여 고객 자신의 지문 또는/및 지정맥 정보를 지문 또는/및 지정맥 결제 서비스 서버로 등록하고, 상거래가 발생되면, 가맹점클라이언트의 지문 또는/및 지정맥 인식기를 이용하여 고객의 지문 또는/및 지정맥 정보를 인증 처리하여 결제가 이루어지도록 한다. 본 발명에 의하면, 남녀를 구분하는 정보로서 남자는 "1", 여자는 "2"로 입력되는 정보는 전자결제시스템에서 어플을 다운받아 지문 또는/및 지정맥을 등록시에 선택사항으로 이루어지며, 고객의 지문 또는/및 지정맥 정보를 이용하여 전자 결제에 필요한 사용자 인증을 처리함으로써, 신용 카드 대체용의 결제 수단의 보안성과 편의성을 제공할 수 있다.