Methods of producing non-immunogenic nanoparticles of protein source by controlling pH during nano-precipitation are described. The nanoparticles produced by the method disclosed above have diameters in the range of from about 100 nm to about 400 nm, preferably diameters in the range of from about 100 nm to about 300 nm, thereby becoming non-immunogenic . The present invention also discloses methods of producing nanoconjugates suitable for treatment, diagnosis and various other uses.나노침전 과정에서 pH를 조절하여 단백질 원천의 비면역원성 나노입자의 생성방법이 기술되어 있다. 상기 개시된 방법에 의해 생성된 나노입자는 직경 크기가 약 100 nm 내지 약 400 nm의 범위에 있으며, 바람직하게는 직경 크기가 약 100 nm 내지 약 300 nm의 범위에 있으며, 이에 의하여 비면역원성이 된다. 또한, 본 발명은 치료, 진단 및 기타 다양한 용도에 적합한 나노접합체의 생성방법을 개시한다.