本发明涉及水稻雄性不育基因OsFIGNL1及其应用。基因OsFIGNL1的核苷酸序列如SEQ ID N0:1所示。通过60Co‑γ诱变获得一个OsFIGNL1功能缺失突变体,该突变体在大田种植环境中表现出植株营养生长正常,植株雄性不育,花粉100%碘败,雌配子发育不受影响。减数分裂压片显示,由于OsFIGNL1功能缺失严重影响了减数分裂过程中染色体的行为,最终导致小孢子发育缺陷。该突变体可应用于水稻杂种优势新品种的培育。基因OsFIGNL1今后可作为一个水稻减数分裂调控的功能基因应用于水稻杂种优势创制工作中,具有巨大的开发利用价值,市场应用前景广阔。