PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a biomagnetic measurement system capable of physically reducing artifacts. A biomagnetic measurement system is a biomagnetic measurement system including a magnetic measurement device for measuring the magnetism of a living body and an electrical stimulator for applying a stimulating current to the living body. , The electrical stimulator includes an artifact confirmation unit that confirms the magnitude of the artifact due to the stimulus current, and the electrical stimulator reduces the artifact after the stimulus current is output based on the information from the artifact confirmation unit. Compensated current can be output. [Selection diagram] FIG. 8【課題】物理的にアーチファクトを低減可能な生体磁気測定システムを提供すること。【解決手段】本生体磁気測定システムは、生体の磁気を測定する磁気測定装置と、前記生体に刺激電流を印加する電気刺激装置と、を有する生体磁気測定システムであって、前記磁気測定装置は、前記刺激電流によるアーチファクトの大きさを確認するアーチファクト確認部を含み、前記電気刺激装置は、前記アーチファクト確認部からの情報に基づいて、前記刺激電流が出力された後に、前記アーチファクトを低減するアーチファクト補償電流を出力可能である。【選択図】図8