Provided are an endoscope system and a pixel correction method which ensure correction of flickering defective pixels in an imaging element. An endoscope system (1) comprises: an illumination control unit (33) which turns off a light source unit (31) at a prescribed cycle a difference calculation unit (52) which calculates differential data between a dark image which corresponds to image data output by an imaging element (244) during lights out when the illumination control unit (33) turns off the light source unit (31) and a dark reference image which is generated in advance in order to detect flickering defective pixels in which electrical signals change irregularly a flickering defective pixel detection unit (53) which detects a flickering defective pixel in the imaging element (244) on the basis of the differential data calculated by the difference calculation unit (52) and a pixel correction unit (561) which corrects an electrical signal output by the flickering defective pixel detected by the flickering defective pixel detection unit (53) using an electrical signal output by another pixel in the vicinity of the flickering defective pixel.La présente invention concerne un système dendoscope et un procédé de correction de pixels qui assurent une correction de pixels défectueux scintillants dans un élément dimagerie. Un système (1) dendoscope comprend : une unité (33) de commande déclairage qui désactive une unité source lumineuse (31) selon un cycle prescrit une unité (52) de calcul de différence qui calcule des données différentielles entre une image sombre qui correspond à des données dimage sorties par un élément dimagerie (244) durant lextinction lorsque lunité (33) de commande déclairage désactive lunité source lumineuse (31) et une image de référence sombre qui est générée à lavance afin de détecter des pixels défectueux scintillants dans lesquels des signaux électriques changent de manière irrégulière une unité (53) de détection de pixels défectueux sci