本发明公开了一种植物雄性育性相关蛋白及其编码基因与应用。本发明提供的蛋白质,是如下(a)或(b)的蛋白质:(a)由SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列组成的蛋白质;(b)将序列1的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且与植物雄性育性相关的由SEQ ID NO.1衍生的蛋白质。本发明的植物雄性育性相关蛋白影响植物的花药开裂过程。抑制该蛋白编码基因的表达可导致植物雄性育性降低,并影响其结实率,从而可以培育雄性花药不开裂变异的转基因植物和植物雄性不育系转基因植物。将所述蛋白的编码基因导入雄性不育植物中,可以培育雄性可育转基因植物。所述蛋白及其编码基因可以应用于植物遗传改良。