The present disclosure identifies genomic loci (eg, vimentin and / or SqBE18) that are differentially methylated in metaplasias (eg, Barrett's esophagus) and / or neoplastic cancers (eg, esophageal cancer). Provide a way to do that. Identification of methylated genomic loci includes, for example, characterizing disease risk, predicting responsiveness to treatment, non-invasively diagnosing a subject, and having gastrointestinal metaplasia and / or neoplasm There are numerous uses, including treating the determined subject.本開示は、化生（例えば、バレット食道）および／または新生物がん（例えば、食道がん）において差次的にメチル化されているゲノム遺伝子座（例えば、ビメンチンおよび／またはＳｑＢＥ１８）を同定するための方法を提供する。メチル化されたゲノム遺伝子座の同定には、例えば、疾患リスクを特徴付ける、治療に対する応答性を予測する、対象を非観血的に診断する、ならびに胃腸管化生および／または新生物を有すると判定された対象を処置することを含む、数多くの用途がある。
