一种高密度遗传图谱的构建方法
- 专利权人:
- 杭州和壹基因科技有限公司
- 发明人:
- 蔡庆乐,唐耀华,何荣军
- 申请号：
- CN201710804279.2
- 公开号：
- CN107644150A
- 申请日:
- 2017.09.08
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2018
- 代理人:
- 唐银益
- 摘要：
- 本发明提供了一种高密度遗传图谱的构建方法，步骤是1)根据遗传分离群体高通量测序数据中得到的SNP标记，对标记进行基因型分型和过滤，再计算两两之间的重组率；2)利用步骤1)算得的重组率，采用分层聚类算法根据前述遗传分离群体的染色体数对SNP标记进行分组，得到与染色体数对应的连锁群；3)采用最小生成树算法对标记进行排序，对排序后的SNP标记进行补缺失和纠错处理，最后计算遗传距离得到遗传图谱。本发明针对不同的遗传分离群体高效、高准确率的构建遗传图谱，为后续的生物信息学分析和遗传学研究提供有力支持。
- 来源网站：
- 中国工程科技知识中心
