The invention relates to a method for controlling vermin present in a space, in particular insects and / or rodents present in a space of a transport container, comprising the steps of providing gaseous carbon dioxide, and bringing the space into the space. gaseous carbon dioxide. By feeding gaseous carbon dioxide, rodents and insects can be effectively controlled without being adversely affected in the material present. The supplied gaseous carbon dioxide can be preheated, or at least introduced at a desired temperature, to prevent insects from ending up in a hibernating state. With this, even these insects that are difficult to control can be combated in a cheap and effective manner. The invention further relates to a system for applying the method.De uitvinding betreft een werkwijze voor het bestrijden van in een ruimte aanwezig ongedierte, in het bijzonder van in een ruimte van een transporthouder aanwezige insecten en/of knaagdieren, omvattende de stappen van het verschaffen van gasvormige koolstofdioxide, en het in de ruimte brengen van de gasvormige koolstofdioxide. Door middel van het toevoeren van gasvormige koolstofdioxide kunnen op doeltreffende wijze knaagdieren en insecten bestreden worden, zonder dat in de aanwezig materiaal nadelig beïnvloed wordt. De toegevoerde gasvormige koolstofdioxide kan voorverwarmd worden, of althans op een gewenste temperatuur worden ingebracht, om te voorkomen dat insecten in een hibernerende toestand terecht komen. Hiermee kunnen zelfs deze op zich moeilijk te bestrijden insecten op een goedkope en doeltreffende wijze bestreden worden. De uitvinding betreft verder een systeem voor toepassing van de werkwijze.