The disclosure provides methods, kits and systems for detecting a metabolite that is metabolized from a nucleotide reverse transcriptase inhibitor in a biological sample obtained from a subject, and uses thereof in monitoring adherence to pre-exposure prophylaxis and counseling subjects who are engaged in or prescribed pre-exposure prophylaxis. The present disclosure also provides methods of preventing HIV infection in patients at risk of contracting infection by monitoring adherence to a regimen and adjusting or modifying the dosing schedule of the regimen accordingly. The metabolite may be detected using proteomic methods, including but not limited to antibody based methods, such as a lateral flow immunoassay or lab based assays such as semi-quantitative LC-MS/MS.L'invention concerne des procédés, des kits et des systèmes pour détecter un métabolite qui est métabolisé à partir d'un inhibiteur de la transcriptase inverse nucléotidique dans un échantillon biologique obtenu à partir d'un sujet, et des utilisations de ceux-ci pour surveiller le respect d'une prophylaxie pré-exposition et conseiller des sujets qui suivent une prophylaxie pré-exposition prescrite ou qui se voient prescrire une telle prophylaxie. La présente invention concerne également des procédés de prévention d'une infection par le VIH chez des patients présentant un risque de contracter une infection en contrôlant le respect d'un schéma thérapeutique et en ajustant ou en modifiant le schéma posologique du schéma thérapeutique en conséquence. Les métabolites peuvent être identifiés à l'aide de procédés protéomiques, notamment, mais pas exclusivement, des procédés à base d'anticorps, tels qu'un test immunologique à écoulement latéral ou des tests en laboratoire tels qu'une LC-MS/MS semi-quantitative.