Disclosed is a method for producing a whole grain cookie, wherein the method comprises a first step (S1) of adding whole grains such as brown rice, black rice, barley, sorghum, beans, and whole wheat in water in order to be soaked for 60-72 hours; a second step (S2) of steaming the soaked whole grains; a third step (S3) of drying the steamed whole grains; a fourth step (S4) of roasting the dried whole grains at a high temperature of 280-300°;C for 2-3 minutes; a fifth step (S5) of mixing the roasted whole grains with nuts, olive oil, and oligosaccharides; and a sixth step (S6) of adding 10-30 g of the whole grains mixed with the nuts, olive oil, and oligosaccharides in a mold (10) in order to be roasted at 150-180°;C for 8 minutes. In the present invention, a cookie is produced using non-pulverized whole grains, so that the effect of consuming whole grains can be directly obtained. The cookie can have natural colors by means of sweet pumpkin powder, green tea powder, cactus powder, purple sweet potato powder, and cocoa powder, and the beneficial components of nuts such as peanuts, almonds, sunflower seeds, walnuts, pine nuts, pecans, cashew nuts, and sesame seeds can be consumed.본 발명은 통곡물 쿠키 제조방법이 개시되는 것으로, 현미, 흑미, 보리, 수수, 찹쌀, 콩, 통밀 등의 통곡물을 물에 넣어 60 ~ 72시간 동안 불리는 제1공정(S1); 불린 통곡물을 쪄서 증숙하는 제2공정(S2); 증숙된 통곡물을 건조하는 제3공정(S3); 건조된 통곡물을 280℃ ~ 300℃의 고온으로 2 ~ 3분 동안 로스팅(roasting)하는 제4공정(S4); 로스팅된 통곡물과 견과류 및 올리브유와 올리고당을 혼합하여 믹싱하는 제5공정(S5); 견과류 및 올리브유, 올리고당이 혼합된 통곡물 10g ~ 30g을 성형틀(10)에 넣은 후 150℃ ~ 180℃ 온도로 8분 동안 굽는 제6공정(S6)으로 이루어진다.본 발명은 곡물을 분쇄하지 않고 통곡물을 그대로 이용하여 쿠키를 제조하기 때문에 먹을 때 통곡물의 효능을 그대로 섭취할 수 있으며 단호박분말, 녹차분말, 백년초분말, 자색고구마분말, 코코아분말에 의해 쿠키의 천연적인 색감을 얻을 수 있을 뿐만 아니라 땅콩, 아몬드, 해바라기씨, 호두, 잣, 피칸, 케슈너트, 참깨 등의 견과류의 유익한 성분을 섭취할 수 있다.