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一种水稻全基因组SNP芯片及其应用
- 专利权人:
- 中国种子集团有限公司
- 发明人:
- 周发松,谢为博,喻辉辉,李菁,张启发
- 申请号：
- CN201210055775.X
- 公开号：
- CN102747138A
- 申请日:
- 2012.03.05
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2012
- 代理人:
- 王敏锋
- 摘要：
- 本发明公开了一种水稻全基因组SNP芯片及其应用，步骤：（1）芯片上第一类探针的获得：通过测序获得亲本的基因组序列，结合公共数据库中的其他水稻品种重测序数据，以日本晴基因组为参考序列，使用MAQ软件将所有测序数据进行匹配、分析，最后从中筛选出SNP标记；（2）芯片上第二类探针的获得：从公共数据库获得水稻功能基因，寻找反映基因功能的序列差异，据此设计出SNP/INDEL探针；(3)利用Infinium芯片制造技术制作SNP芯片。(4)测试芯片的准确性和应用效率。本芯片可应用于水稻种质资源分子标记指纹分析、种子真实性检测、杂交后代基因分型，以及其他相关研究中。
- 来源网站：
- 中国工程科技知识中心
- 来源网址：
- http://www.ckcest.cn/home/
