本发明属于家畜分子遗传标记制备技术领域,具体涉及一种猪产仔数性状的遗传标记及应用。以猪STIM1基因第10内含子末端序列的一个T碱基插入/缺失突变作为猪产仔数性状相关的遗传标记。本发明通过制备得到一种与猪产仔数性状相关的遗传标记,所述的遗传标记的核苷酸序列如序列表SEQ ID NO:1或SEQ ID NO:2所示,在SEQ ID NO:1所示序列的第256bp处存在一个T碱基的插入突变;在SEQ ID NO:2所示序列的第256bp处存在一个T碱基的缺失突变;所述的突变可显著影响猪产仔数性状。还公开了该遗传标记的制备方法及其在猪产仔性状关联分析中的应用。为猪产仔数性状的分子标记辅助育种提供了一个新的遗传标记。