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对水产养殖环境沉积物中反硝化微生物的定量方法
- 专利权人:
- 中国石油大学(华东)
- 发明人:
- 李静,刘建国,杨杏娜,肖梓军,郗丽君,赵静宜
- 申请号:
- CN201510563030.8
- 公开号:
- CN105132553A
- 申请日:
- 2015.09.07
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2015
- 代理人:
- 摘要:
- 本发明是一种对水产养殖环境沉积物中的反硝化微生物进行实时荧光定量PCR(qPCR)检测的方法,属于环境微生物生态学技术领域。内容包括各站位沉积物样品宏基因组DNA的提取和浓度测定,nirK和nirS基因的PCR扩增,标准质粒的构建,标准曲线的制作、qPCR扩增,根据qPCR的结果对照标准曲线计算样品中反硝化微生物的数量。本发明通过对nirK和nirS两种基因的定量分析,来确定水产养殖环境中反硝化微生物的数量,克服了16S rRNA基因无法在反硝化微生物定量中使用的缺点,和现有技术只关注某一功能基因造成的定量不全面的缺点,提供了一种特异性好、重复性高、准确度高的检测水产养殖环境中反硝化微生物数量的方法。本方法得到的nirK和nirS基因拷贝数的对数值与荧光阈值Ct值线性关系好,标准曲线的回归系数在0.99以上。
- 来源网站:
- 中国工程科技知识中心
- 来源网址:
- http://www.ckcest.cn/home/