本发明提供一种调控水稻耐铝毒基因,该耐铝毒基因包含如SEQ ID No.1所示的核苷酸序列。本发明公开了上述基因编码的蛋白,其氨基酸序列如SEQ ID No.2所示。本发明还公开了一种检测耐铝水稻的特异性PCR检测引物对,所述引物如SEQ ID No.11、SEQ ID No.12所示,以及一种OsAlR3蛋白亚细胞定位方法。本发明公开了一种调节植物Al3+耐受性的方法,通过将包含耐铝毒基因序列的核酸导入到植物或植物细胞中,并使所述核酸在所述植物或植物细胞中表达,使植株获得耐铝毒的能力。本发明利用基因工程手段获得一种水稻耐铝毒调控基因,为培育优良耐铝毒水稻品种奠定基础。