Devices, systems and methods are provided for generating in vivo maps of biological tissue oxygenation measurements. These include surgical instruments with independent oxygen sensing capabilities and stand-alone imaging systems. The oxygenation map can be determined via fluorescence or phosphorescence lifetime imaging of the injectable probe with an oxygen dependent optical response. Probe configurations and methods and apparatus for injecting probes into tissue are also provided. A method and apparatus for temperature compensation of temperature dependent lifetime measurements is also provided to improve oxygenation measurement accuracy. The oxygen map may be aligned with the visible light image to assist in assessing tissue viability or to identify abnormalities within the tissue. The resulting oxygen imaging includes but is not limited to the induction of surgical procedures such as colorectal resection through the use of intraoperative sensing, enhanced endoscopic imaging to identify suspicious lesions during colonoscopy and It may be used for a variety of applications including external imaging of tissue, such as assessment of peripheral vascular disease.生物組織の酸素化測定の生体内マップを生成する、装置、システムおよび方法が提供される。これらは、取り込まれた酸素の感知能力を伴う外科手術用器具および独立型撮像システムを含む。酸素化マップは酸素依存光学応答を伴う注入可能プローブの蛍光または燐光寿命撮像を介して判定されることができる。プローブ構成ならびにプローブを組織の中に注入する方法および装置も提供される。温度依存寿命測定の温度補償のための方法および装置も酸素化測定正確度を改良するために提供される。酸素マップは可視光画像と位置合わせされ組織生存性の査定を補助するまたは組織内の異常を特定してもよい。結果として生じる酸素画像は限定ではないが術中感知の使用を通した結腸直腸切除術等の外科手術手技の誘導、大腸内視鏡検査中の疑わしい病変を識別するための向上した内視鏡撮像および末梢血管疾患の査定等の組織の外部撮像を含む種々の用途のために使用されてもよい。