The present invention relates to a method for introducing an intracellular protein with a high efficiency, more particularly biological functional material such as proteins, nucleic acids, drugs using specific short mitochondrial target peptide, sMTS of method for the introduction and to significantly improve the maintenance efficiency of cell fusion and to a composition used therein.본 발명은 높은 효율로 세포내 단백질을 도입하는 방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 특정의 짧은 미토콘드리아 표적 펩타이드, sMTS를 이용하여 단백질, 핵산, 약물 등과 같은 생체 기능성 물질의 세포내 도입 및 유지 효율을 현저히 향상시키기 위한 방법 및 이에 사용되는 융합체 조성물에 관한 것이다.