PURPOSE: A pharmaceutical composition containing TRAP80 controlling agent is provided to selectively suppress SREBP-1c transcription and to effectively treat or prevent metabolic syndrome. CONSTITUTION: A pharmaceutical composition for preventing or treating metabolic syndrome contains TRAP80 controlling agent as an active ingredient. The TRAP80 controlling agent is a siRNA which suppresses TRAP80 expression and an antibody which specifically binds to TRAP80. The pharmaceutical composition for preventing or treating metabolic syndrome contains LXR(liver X receptor) agonist. A method for screening a drug for treating metabolic syndrome comprises: a step of contacting a candidate drug to blood or tissue of a patient with metabolic syndrome; and a step of evaluating suppression of interaction between LXR and TRAP80.본 발명은 TRAP80 조절제를 유효성분으로 함유하는 대사증후군 치료 또는 예방용 약학조성물에 관한 것으로, 상기 TRAP80 조절제 예를들어, TRAP80 발현을 억제하는 siRNA 또는 TRAP80에 특이적으로 결합하는 항체는 SREBP-1c의 전사를 선택적으로 억제하여 동맥경화, 지방간 등과 같은 대사증후군을 효과적으로 치료하거나 예방할 수 있다. 또한, TRAP80 조절제와 함께 LXR 효능제를 포함하는 약학조성물은 LXR 효능제의 원치않는 효과인 혈청 트리글리세라이드 및 간 트리글리세라이드 증가와 같은 지방산 대사 활성을 억제할 수 있어 혈청 HDL을 증가시키며 동맥경화를 감소시키는 등의 LXR 효능제의 바람직한 효과를 증진시킬 수 있기 때문에 LXR 효능제에 의한 동맥경화성 질환이나 지방간 등과 같은 대사증후군의 치료제로서의 효과를 더욱 향상시킬 수 있다.