本发明涉及一种利用特异SSR分子标记结合荧光毛细管电泳检测技术对仁用杏种质鉴定的方法，包括如下步骤：利用分子标记引物PCR扩增标准种质；利用分子标记引物PCR扩增目标种质，目标种质即为待鉴定的种质；将以上两个步骤得到的扩增结果利用毛细管电泳检测技术检测后进行比对，根据比对结果是否一致进行种质鉴定，其中，所用的分子标记选自如下SSR标记，UDP98‑409、UDP98‑406、UDP97‑401、pchgms12、MA039a、MA020a、BPPCT002、BPPCT007和BPPCT008，所述SSR分子标记的正向引物序列和反向引物序列依次如SEQ ID NO:1‑18所示。本发明还涉及以上用到的SSR引物以及应用所述SSR引物构建的仁用杏遗传多样性分析方法。
