本发明公开一种茎瘤芥硫苷酶基因MYR1、茎瘤芥硫苷酶及其基因工程表达方法,所述茎瘤芥硫苷酶基因MYR1核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;所述茎瘤芥硫苷酶氨基酸序列为SEQ ID NO.2所示;茎瘤芥硫苷酶的基因工程表达方法,提取茎瘤芥叶片中的总RNA,再采用RT-PCR法扩增硫苷酶基因MYR1,并构建表达载体,采用毕赤酵母表达系统进行表达,利用SalI酶切位点线性化载体,转化入毕赤酵母基因组,通过G418抗性,筛选出遗传霉素抗性转化子,采用甲醇诱导表达。经电泳分析,本发明重组子能进行表达,表达蛋白分子量为90KDa,测定纯化后蛋白的比活力,茎瘤芥硫苷酶的比活力约等于0.003U/μL。