The present invention aims at diagnosing brain diseases more accurately and in detail. A diagnostic server (10) of a brain disease diagnosis system (1) for diagnosing a brain disorder of a screener comprises an acquisition unit (11) for acquiring a brain image of a screener and taking a brain image of the examinee, An individual index value calculating section (13) for calculating an individual index value based on the pixel value of the acquired image for each of the region (12) and the plurality of regions, and the individual index values of the plurality of regions A total index value calculating unit 14 for calculating an index value, a diagnosis unit 15 for diagnosing a brain disease of the examinee based on the total index value, and an output unit 16 for outputting information indicating a diagnosis result.본 발명은 보다 정확하고 상세하게 뇌 질환의 진단을 실시하는 것을 목적으로 한다. 검진자의 뇌 질환을 진단하는 뇌 질환 진단 시스템 (1)의 진단 서버 (10)는 검진자의 뇌 화상을 취득하여 취득 화상으로 하는 취득부 (11)와 취득 화상에 있어서 복수의 영역을 설정하는 영역 설정부 (12)와 복수의 영역 각각에 대해 취득 화상의 화소값에 기초하여 개별 지표값을 산출하는 개별 지표값 산출부 (13)와 복수의 영역 각각의 개별 지표값에 대해 중요도 매김을 실시함으로써 전체 지표값을 산출하는 전체 지표값 산출부 (14)와 전체 지표값에 기초하여 검진자의 뇌 질환을 진단하는 진단부 (15)와 진단 결과를 나타내는 정보를 출력하는 출력부 (16)를 구비한다.
