The present invention relates to a method of analysis impairment APE1 active site control and treatment of cancer and a base cut recovery system using the same in the Gadd45a protein.The control APE1 activity in the Gadd45a according to the invention, the site is not only used as a marker that can be analyzed for damage base cut recovery system, useful can be used to inhibit the proliferation of cancer cells by administration of an siRNA that targets them .Gadd45a, PCNA, APE1본 발명은 Gadd45a 단백질 내의 APE1 활성 조절 사이트 및 이를 이용한 암의 치료 및 염기 절단 복구 시스템의 손상 여부 분석 방법에 관한 것이다.본 발명에 따른 Gadd45a 내의 APE1 활성 조절 사이트는 염기 절단 복구 시스템의 손상 여부를 분석할 수 있는 마커로 활용할 수 있을 뿐만 아니라, 이를 타겟팅하는 siRNA를 투여함으로써 암세포의 증식을 억제하기 위해 유용하게 사용될 수 있다.