本发明公开了一种万寿菊类胡萝卜素合成途径紫黄质脱环氧化酶基因Tagetes erecta violaxanthin de‑epoxidase(TeVDE1),特征是其核苷酸序列如序列表中SEQ ID NO:1所示;其氨基酸序列如序列表中SEQ ID NO:2所示。在万寿菊花瓣组织中克隆获得了TeVDE1基因。实时定量分析和叶黄素含量测定结果表明TeVDE1基因在万寿菊花蕾中表达量较高,其表达水平与叶黄素含量相关。所述SEQ ID NO:1基因在叶黄素合成积累方面具有作用,本发明从色素万寿菊中克隆类胡萝卜素合成途径紫黄质脱环氧化酶基因能够用于提高叶黄素等类胡萝卜素色素含量。