methods and systems for isolating carotenoid products and algae-rich omega-3 oils. The present invention relates to a method for isolating nutraceutical products from algae which is provided. One method for isolating algae omega-3 carotenoids and oil includes dehydrating substantially intact algal cells to make an algae biomass and adding a first fraction of ethanol to the algae biomass. The method also includes separating a first substantially solid biomass fraction from a first substantially liquid fraction comprising proteins and combining the first substantially solid biomass fraction with a second ethanol fraction. The method also includes separating a second substantially solid biomass fraction from a second substantially liquid fraction comprising polar lipids and combining the second sub-substantially solid biomass fraction with a third substantially solid biomass fraction from a third substantially liquid fraction comprising neutral lipids, wherein The third fraction of substantially solid biomass comprises carbohydrates and separate neutral lipids into carotenoids and omega-3 rich oil.métodos e sistemas para isolar produtos carotenoides e óleos ricos em ômega-3 de algas. a presente invenção refere-se a um método para isolar produtos nutracêuticos de algas que é fornecido. um método para isolar carotenoides e óleo rico em ômega 3 de algas inclui desidratar células de algas substancialmente intactas para fazer uma biomassa de algas e adicionar uma primeira fração de etanol à biomassa de algas. o método também inclui separar uma primeira fração de biomassa substacialmente sólida de uma primeira fração substancialmente líquida compreendendo proteínas e combinar a primeira fração de biomassa substancialmente sólida com uma segunda fração de etanol. o método também inclui separar uma segunda fração de biomassa substancialmente sólida de uma segunda fração substancialmente líquida compreendendo lipídios polares e combinar a segunda fração de biomassa subastancial