Systems and methods are provided that allow for the selection of tumor neoepitopes, which are then used to generate recombinant nucleic acids encoding one or more polytopes optimized for proper trafficking and processing. In a preferred method, the polytope is encoded into a plasmid and / or viral expression system for use as a therapeutic.종양 네오에피토프의 선택을 가능하게 하는 시스템 및 방법이 제공되며, 이어서 이 종양 네오에피토프는 적절한 트래피킹 및 가공을 위해 최적화된 하나 이상의 폴리토프를 인코딩하는 재조합 핵산을 생성하는 데 사용된다. 바람직한 방법에서, 폴리토프는 치료제로서 사용하기 위해 플라스미드 및/또는 바이러스 발현 시스템으로 인코딩된다.