The present invention relates to a stroke lesion diagnosis system based on images and a method, and more specifically, to a stroke lesion diagnosis system based on medical images for diagnosis and prescriptions of a stroke and a method. To attain the purpose, the stroke lesion diagnosis system based on images according to one embodiment of the present invention comprises: a receiving unit which receives a diffusion-weighted image (DWI) of a body part having a lesion of an examinee and a perfusion-weighted image (PWI) from an image diagnosis device (modality) or a database; a registering unit which registers the DWI and the PWI; a user menu providing unit which provides a user menu which can determine a display option for the DWI and the PWI; an input translating unit which responds to a user input passed through the user menu and translates the display option; and a display control unit which displays at least one of the DWI and the PWI on a screen.본 발명은 영상 기반 뇌졸중 병변 진단 시스템 및 방법에 관한 것으로, 보다 상세하게는 뇌졸중 진단 및 처방을 위한 의료 영상 기반의 뇌졸중 병변 진단 시스템 및 방법에 관한 것이다.이러한 목적을 달성하기 위하여 본 발명의 일 실시예에 따른 영상 기반 뇌졸중 병변 진단 시스템은 영상 진단 장치(modality)로부터 또는 데이터베이스로부터 피검자의 병변을 포함하는 신체 부위의 확산 강조 영상(DWI, Diffusion-weighted Image) 및 관류 강조 영상(PWI, Perfusion-weighted Image)을 수신하는 수신부, 상기 확산 강조 영상 및 상기 관류 강조 영상을 정합하는(registering) 정합부, 상기 확산 강조 영상 및 상기 관류 강조 영상에 대한 표시 옵션을 결정할 수 있는 사용자 메뉴를 제공하는 사용자 메뉴 제공부, 상기 사용자 메뉴를 경유한 사용자 입력에 응답하여 상기 표시 옵션을 해석하는(translate) 입력 해석부, 및 상기 표시 옵션에 따라 상기 확산 강조 영상 및 상기 관류 강조 영상 중 적어도 하나 이상을 화면 상에 표시하는 표시 제어부를 포함할 수 있다.