A method of controlling the primary drying stage in a freeze drying apparatus having a shelf and bulk product or a number of vials in different, areas on the shelf which contain product to be freeze dried. Temperature sensors are positioned in selected locations or vials which are representative of the different bulk product areas or the positions of all of the vials in different areas of the shelf. The temperature sensors are monitored and compared to determine the selected location or vial having the highest temperature while the temperature sensor therein is still in ice. The shelf temperature is controlled based on the selected location or vial with the highest temperature so long as the temperature sensor therein is still in ice. When the temperature sensor in the highest temperature selected location or vial is no longer in ice, another selected location or vial with the highest temperature and a temperature sensor therein that is still in ice is then used to control the shelf temperature.Linvention porte sur un procédé de commande de la phase de séchage primaire dans un appareil de lyophilisation ayant un produit détagère et un produit en vrac ou plusieurs flacons, dans différentes zones sur létagère, qui contiennent un produit à lyophiliser. Des capteurs de température sont positionnés dans des emplacements ou des flacons sélectionnés qui sont représentatifs des différentes zones de produits en vrac ou des positions de lensemble des flacons dans différentes zones de létagère. Les capteurs de température sont surveillés et comparés pour déterminer lemplacement ou le flacon sélectionné ayant la température la plus élevée alors que le capteur de température dans celui-ci est toujours dans de la glace. La température de conservation est régulée sur la base de lemplacement ou du flacon sélectionné ayant la température la plus élevée tant que le capteur de température dans celui-ci est toujours dans de la glace. Lorsque le capteur de température dans lemplacement