The endoscope system generates a first and second feature amount distribution image of a biological tissue from a captured image of the biological tissue, and generates a second feature amount distribution processing image from the distribution image, and the second feature. And a display for displaying the quantity distribution processed image. In the first feature amount distribution image, the processor sets pixels whose pixel values representing the first feature amount are less than a lower limit value as non-transparent pixels having a transmittance of 0, and pixels between the upper limit value and the lower limit value In addition, a mask image of the second feature amount distribution image is generated by giving a transmittance which is determined continuously or stepwise according to the pixel value to obtain a transparent pixel. The processor further generates a second feature quantity distribution processed image in which the mask image is superimposed on an upper layer of the second feature quantity distribution image.内視鏡システムは、生体組織の撮像画像から生体組織の第１、２特徴量分布画像を生成し、こられの分布画像から第２特徴量分布処理画像を生成するプロセッサと、前記第２特徴量分布処理画像を画像表示するディスプレイと、を備える。前記プロセッサは、前記第１特徴量分布画像において、前記第１特徴量を表す画素値が下限値未満の画素を透過率が０の不透過画素とし、上限値と前記下限値の間にある画素に、前記画素値に応じて、連続的にあるいは段階的に定まる透過率を与えて透過画素とすることにより、前記第２特徴量分布画像のマスク画像を生成する。前記プロセッサは、さらに、前記第２特徴量分布画像の上層に前記マスク画像を重ねた第２特徴量分布処理画像を生成する。
