本发明公开了重组融合蛋白CD4-LINKER-DC-SIGN(CLD)的多肽、编码序列及制备方法和应用。重组融合蛋白CLD,其序列为SEQ ID NO.1-16中奇数序列所示核苷酸序列和SEQ ID NO.1-16偶数序列所示氨基酸序列,其步骤:第一以克隆于质粒的人CD4和DC-SIGN全长cDNA为模板,通过PCR扩增,得到目的片段;第二酶切PCR产物和原核载体,构建重组表达载体;第三将获得的表达载体转化大肠杆菌,得到表达重组蛋白CLD的工程菌;第四通过诱导培养至一定浓度的工程菌后获得培养产物;第五稀释法复性蛋白;第六Ni2+亲和层析法分离、纯化经过复性的蛋白。蛋白纯化综合采用稀释复性与Ni2+亲和层析,能使蛋白纯度达到90%以上。本发明所涉及蛋白具有抗HIV-1吸附和感染的双重活性,在开发治疗/预防HIV-1的药物方面具有很大价值。