本发明提供了一种马铃薯KNOX转录因子StKNOX1基因、编码蛋白及其在马铃薯种植或马铃薯育种中的应用,属于基因工程技术领域。本发明提供的马铃薯KNOX转录因子StKNOX1基因,其核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。将StKNOX1基因转入马铃薯植株中,通过转StKNOX1基因马铃薯生理性状分析得到,转基因阳性株系中StKNOX1基因表达量显著高于对照,三个阳性株系的株高、单株结薯个数、单株产量均显著大于对照组;同时转基因株系均表现出了分支数增加,块茎长宽比增加,块茎形状发生改变等性状。因此,本发明提供了StKNOX1基因在马铃薯种植或马铃薯育种中的应用。