A method is provided for treating a seaweed extract having a target molecule and a pyrogenic agent. The method includes inactivating the pyrogenic agent and/or removing the pyrogenic agent. The method results in a reduction in pyrogenicity of the extract. The method is useful in the preparation of pharmaceutical compositions and biomaterials for which pyrogen removal is critical.본 발명은 발열물질을 비활성화 및/또는 발열물질을 제거하는 단계를 포함하여, 추출물의 발열성을 감소시키는 결과를 가져오는 것인, 표적 분자(target molecule) 및 발열물질을 포함하는 해조류를 처리하는 방법을 제공한다. 본 발명의 방법은 발열인자의 제거가 중요한 의약 조성물 및 바이오 재료를 제조하는데 유용하다.