PROBLEM TO BE SOLVED: To provide an image processing system that enables a doctor to easily check in what region of the eyeground an abnormality occurs, when the eyeground assumes an abnormal shape, an operation method for the same, and a program.SOLUTION: An image processing system includes information acquisition means for acquiring information indicating shapes of a plurality of areas of at least one layer of a tomographic image including a plurality of layers of the eyeground of a subject's eye, and determination means for determining whether or not an abnormality occurs in the plurality of areas, on the basis of the information indicating the shapes.【課題】 医者が、眼底の形状が異常である場合に、眼底のどこの領域に異常が生じているのかを容易に確認できる画像処理装置、その作動方法及びプログラムを提供する。【解決手段】 画像処理装置が、被検眼の眼底の複数の層を含む断層画像における少なくとも1つの層の複数の領域の形状を示す情報を取得する情報取得手段と、前記形状を示す情報に基づいて前記複数の領域において異常が生じているか否かを決定する決定手段と、を有する。【選択図】 図6