本发明公开了一种陆地棉GhCM2蛋白及其编码基因和应用，属于分子生物学技术领域。具体公开一种蛋白，包括：1)由如SEQ ID NO：2所示的氨基酸序列组成的蛋白质；2)将如SEQ ID NO：2所示的氨基酸序列经过取代和/或缺失和/或添加一个或几个氨基酸残基且与植物黄萎病抗性相关的由SEQ ID NO：2衍生的蛋白质。本发明克隆棉花GhCM2基因，该基因为典型的DCD超蛋白家族基因，介导了细胞的程序性死亡，通过基因沉默和超表达分析，证实其在高抗黄萎病品种的叶片和根系中的协同性表达，可以提高抗黄萎病性的能力，这对于高产感病棉花或其他农作物品种的抗黄萎病性的遗传改良具有重要意义。
