本发明公开了一种茶树2-异丙基苹果酸合酶表达序列标签及其生物芯片。表达序列标签具有SEQ ID No.1所示的序列;所示序列的互补序列或同源序列;所示序列中8~100个连续核苷酸为探针的序列或其互补序列。运用表达序列标签技术对构建的茶树互补脱氧核糖核酸(cDNA)文库进行脱氧核糖核酸序列测定,获得的表达序列标签通过剔除冗余序列、互联网数据库进行检索、分类,获得了一条茶树2-异丙基苹果酸合酶的特异表达序列标签,本发明可应用于作物种质资源的鉴定评价、作物杂种优势的早期预测、作物育种和新品种的产生与鉴定、植物抗逆性的研究、植物单核苷酸多态性(SNP)的检定、转基因农产品的安全性检测、新型除草剂和新型农药的筛选等。