The invention described herein provides for methods and systems for determining, selecting, and/or treating diseases and conditions caused by or associated with high quantities of methanogens in a subject, or diseases and conditions caused by or associated with low quantities of methanogens in a subject. In various embodiments, a therapy to inhibit the growth of methanogens or to promote the growth of methanogens are selected and/or administered to a subject in need thereof.L'invention concerne des méthodes et des systèmes de détermination, de sélection et/ou de traitement de maladies et d'états causés par ou associés à des quantités élevées de bactéries méthanogènes chez un sujet, ou de maladies et d'états causés par ou associés à de faibles quantités de bactéries méthanogènes chez un sujet. Selon divers modes de réalisation, une thérapie permettant d'inhiber la croissance des bactéries méthanogènes ou de promouvoir la croissance des bactéries méthanogènes est sélectionnée et/ou administrée à un sujet qui en a besoin.