PROBLEM TO BE SOLVED: To provide molecular markers for detecting cancer stem cells.SOLUTION: Provided is a molecular marker for detecting cancer stem cells in a target cell population, which molecular marker is detected in a cancer stem cell in the target population but not in cancer cells other than cancer stem cells and normal cells. The molecular marker may be an expression product of one or more genes selected from Or7c1, Dnajb8, Sox2, Smcp, Ints1, Kox12, Mdf1, FLJ13464, 667 J232, Surf6, Pcdh19, Dchs2, Pcdh21, Gal3 st1, Rasl11b, Hes6, Znf415, Nkx2-5, Pamci, Pnmt and Scgb3a1. Also provided are a probe and/or a primer having a base sequence complementary to the gene for detecting mRNA being an expression product of the gene, an antibody for detecting a polypeptide being an expression product of the gene and a nucleic acid for inhibiting the expression of the gene.SELECTED DRAWING: Figure 28【課題】癌幹細胞を検出する為の分子マーカーの提供。【解決手段】検出対象となる細胞集団において癌幹細胞を検出する為の分子マーカーで、検出対象に含まれる癌幹細胞において検出されるが、癌幹細胞でない癌細胞及び正常細胞で検出されない、分子マーカー。Or7c1、Dnajb8、Sox2、Smcp、Ints1、Kox12、Mdf1、FLJ13464、667J232、Surf6、Pcdh19、Dchs2、Pcdh21、Gal3st1、Rasl11b、Hes6、Znf415、Nkx2-5、Pamci、Pnmt又はScgb3a1から選択される1以上の遺伝子の発現産物である、分子マーカー、前記遺伝子の発現産物であるmRNAを検出する為の前記遺伝子に相補的な塩基配列を有するプローブ及び/又はプライマー、前記遺伝子の発現産物であるポリペプチドを検出する為の抗体及び前記遺伝子の発現を抑制する為に用いられる、核酸。【選択図】図28