Provided herein are systems and methods that enable automated differentiation of a 3D image of a subject to distinguish ectopic osteoporosis (HO), normal skeleton, and regions of soft tissue. In certain embodiments, the method identifies discrete and distinguishable regions of the 3D image (eg, CT or microCT image) of the subject that can then be manually or automatically classified as HO or normal skeleton. .이소성 골화증(HO), 정상 골격, 및 연질 조직의 영역들을 구별하기 위하여 대상체의 3D 이미지의 자동화된 구분화를 가능하게 하는 시스템 및 방법이 본원에서 제공된다. 특정 실시예에 있어서, 방법은, 그 이후에 수동으로 또는 자동으로 HO 또는 정상 골격으로서 분류될 수 있는 대상체의 3D 이미지(예를 들어, CT 또는 마이크로CT 이미지)의 이산적이고 구별가능한 영역을 식별한다.
